Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms