Protein–RNA interactions for Protein: Q99M71

Epdr1, Mammalian ependymin-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epdr1Q99M71 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Epdr1Q99M71 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms