Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ8

Nus1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Nus1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nus1Q99LJ8 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nus1Q99LJ8 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nus1Q99LJ8 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nus1Q99LJ8 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nus1Q99LJ8 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Nus1Q99LJ8 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nus1Q99LJ8 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nus1Q99LJ8 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nus1Q99LJ8 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nus1Q99LJ8 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Nus1Q99LJ8 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Nus1Q99LJ8 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Nus1Q99LJ8 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Nus1Q99LJ8 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nus1Q99LJ8 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nus1Q99LJ8 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nus1Q99LJ8 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nus1Q99LJ8 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nus1Q99LJ8 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nus1Q99LJ8 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nus1Q99LJ8 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nus1Q99LJ8 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nus1Q99LJ8 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nus1Q99LJ8 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nus1Q99LJ8 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nus1Q99LJ8 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nus1Q99LJ8 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nus1Q99LJ8 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nus1Q99LJ8 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nus1Q99LJ8 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nus1Q99LJ8 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Nus1Q99LJ8 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nus1Q99LJ8 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nus1Q99LJ8 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nus1Q99LJ8 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nus1Q99LJ8 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nus1Q99LJ8 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nus1Q99LJ8 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nus1Q99LJ8 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nus1Q99LJ8 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nus1Q99LJ8 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nus1Q99LJ8 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nus1Q99LJ8 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nus1Q99LJ8 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nus1Q99LJ8 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nus1Q99LJ8 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nus1Q99LJ8 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Nus1Q99LJ8 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nus1Q99LJ8 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nus1Q99LJ8 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nus1Q99LJ8 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nus1Q99LJ8 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Nus1Q99LJ8 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Nus1Q99LJ8 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Nus1Q99LJ8 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Nus1Q99LJ8 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nus1Q99LJ8 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nus1Q99LJ8 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nus1Q99LJ8 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Nus1Q99LJ8 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nus1Q99LJ8 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nus1Q99LJ8 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Nus1Q99LJ8 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
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Nus1Q99LJ8 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nus1Q99LJ8 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nus1Q99LJ8 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nus1Q99LJ8 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nus1Q99LJ8 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nus1Q99LJ8 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nus1Q99LJ8 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nus1Q99LJ8 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nus1Q99LJ8 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nus1Q99LJ8 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nus1Q99LJ8 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nus1Q99LJ8 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nus1Q99LJ8 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nus1Q99LJ8 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nus1Q99LJ8 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nus1Q99LJ8 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nus1Q99LJ8 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nus1Q99LJ8 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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