Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms