Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hps4Q99KG7 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hps4Q99KG7 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hps4Q99KG7 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hps4Q99KG7 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hps4Q99KG7 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hps4Q99KG7 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hps4Q99KG7 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hps4Q99KG7 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hps4Q99KG7 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hps4Q99KG7 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hps4Q99KG7 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hps4Q99KG7 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hps4Q99KG7 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hps4Q99KG7 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hps4Q99KG7 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hps4Q99KG7 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hps4Q99KG7 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hps4Q99KG7 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hps4Q99KG7 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hps4Q99KG7 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hps4Q99KG7 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hps4Q99KG7 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hps4Q99KG7 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hps4Q99KG7 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hps4Q99KG7 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hps4Q99KG7 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hps4Q99KG7 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hps4Q99KG7 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hps4Q99KG7 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hps4Q99KG7 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hps4Q99KG7 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hps4Q99KG7 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hps4Q99KG7 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hps4Q99KG7 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hps4Q99KG7 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hps4Q99KG7 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hps4Q99KG7 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hps4Q99KG7 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hps4Q99KG7 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hps4Q99KG7 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hps4Q99KG7 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hps4Q99KG7 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hps4Q99KG7 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hps4Q99KG7 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hps4Q99KG7 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hps4Q99KG7 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hps4Q99KG7 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hps4Q99KG7 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hps4Q99KG7 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hps4Q99KG7 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hps4Q99KG7 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hps4Q99KG7 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hps4Q99KG7 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hps4Q99KG7 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hps4Q99KG7 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hps4Q99KG7 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hps4Q99KG7 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hps4Q99KG7 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hps4Q99KG7 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hps4Q99KG7 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hps4Q99KG7 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms