Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms