Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Slc8b1Q925Q3 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Slc8b1Q925Q3 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Slc8b1Q925Q3 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Slc8b1Q925Q3 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Slc8b1Q925Q3 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Slc8b1Q925Q3 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Slc8b1Q925Q3 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Slc8b1Q925Q3 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Slc8b1Q925Q3 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Slc8b1Q925Q3 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Slc8b1Q925Q3 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Slc8b1Q925Q3 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Slc8b1Q925Q3 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Slc8b1Q925Q3 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Slc8b1Q925Q3 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Slc8b1Q925Q3 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Slc8b1Q925Q3 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Slc8b1Q925Q3 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Slc8b1Q925Q3 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Slc8b1Q925Q3 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Slc8b1Q925Q3 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Slc8b1Q925Q3 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Slc8b1Q925Q3 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Slc8b1Q925Q3 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Slc8b1Q925Q3 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Slc8b1Q925Q3 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Slc8b1Q925Q3 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Slc8b1Q925Q3 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Slc8b1Q925Q3 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Slc8b1Q925Q3 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Slc8b1Q925Q3 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Slc8b1Q925Q3 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Slc8b1Q925Q3 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Slc8b1Q925Q3 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Slc8b1Q925Q3 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Slc8b1Q925Q3 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Slc8b1Q925Q3 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Slc8b1Q925Q3 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Slc8b1Q925Q3 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Slc8b1Q925Q3 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Slc8b1Q925Q3 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Slc8b1Q925Q3 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Slc8b1Q925Q3 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Slc8b1Q925Q3 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Slc8b1Q925Q3 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Slc8b1Q925Q3 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Slc8b1Q925Q3 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Slc8b1Q925Q3 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Slc8b1Q925Q3 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Slc8b1Q925Q3 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Slc8b1Q925Q3 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Slc8b1Q925Q3 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Slc8b1Q925Q3 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Slc8b1Q925Q3 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Slc8b1Q925Q3 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Slc8b1Q925Q3 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Slc8b1Q925Q3 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Slc8b1Q925Q3 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Slc8b1Q925Q3 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Slc8b1Q925Q3 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Slc8b1Q925Q3 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Slc8b1Q925Q3 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Slc8b1Q925Q3 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Slc8b1Q925Q3 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Slc8b1Q925Q3 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Slc8b1Q925Q3 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Slc8b1Q925Q3 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Slc8b1Q925Q3 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Slc8b1Q925Q3 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Slc8b1Q925Q3 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Slc8b1Q925Q3 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Slc8b1Q925Q3 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Slc8b1Q925Q3 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Slc8b1Q925Q3 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Slc8b1Q925Q3 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Slc8b1Q925Q3 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Slc8b1Q925Q3 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Slc8b1Q925Q3 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Slc8b1Q925Q3 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Slc8b1Q925Q3 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Slc8b1Q925Q3 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Slc8b1Q925Q3 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Slc8b1Q925Q3 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Slc8b1Q925Q3 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Slc8b1Q925Q3 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Slc8b1Q925Q3 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Slc8b1Q925Q3 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Slc8b1Q925Q3 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Slc8b1Q925Q3 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Slc8b1Q925Q3 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Slc8b1Q925Q3 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Slc8b1Q925Q3 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Slc8b1Q925Q3 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Slc8b1Q925Q3 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Slc8b1Q925Q3 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms