Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Cldn16Q925N4 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
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