Protein–RNA interactions for Protein: Q924C5

Alpk3, Alpha-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alpk3Q924C5 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Alpk3Q924C5 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Alpk3Q924C5 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Alpk3Q924C5 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Alpk3Q924C5 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Alpk3Q924C5 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Alpk3Q924C5 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Alpk3Q924C5 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Alpk3Q924C5 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Alpk3Q924C5 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Alpk3Q924C5 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Alpk3Q924C5 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Alpk3Q924C5 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Alpk3Q924C5 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Alpk3Q924C5 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Alpk3Q924C5 Gm16459-201ENSMUST00000121443 686 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Alpk3Q924C5 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Alpk3Q924C5 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Alpk3Q924C5 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Alpk3Q924C5 Gm37197-201ENSMUST00000195607 401 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Alpk3Q924C5 Elob-201ENSMUST00000069579 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Alpk3Q924C5 P2rx7-202ENSMUST00000086247 712 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Alpk3Q924C5 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Alpk3Q924C5 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Alpk3Q924C5 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Alpk3Q924C5 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Alpk3Q924C5 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Alpk3Q924C5 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Alpk3Q924C5 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Alpk3Q924C5 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Alpk3Q924C5 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Alpk3Q924C5 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Alpk3Q924C5 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Alpk3Q924C5 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Alpk3Q924C5 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Alpk3Q924C5 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Alpk3Q924C5 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Alpk3Q924C5 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Alpk3Q924C5 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Alpk3Q924C5 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Alpk3Q924C5 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Alpk3Q924C5 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Alpk3Q924C5 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Alpk3Q924C5 Hoxd3os1-203ENSMUST00000145799 511 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Alpk3Q924C5 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Alpk3Q924C5 Gm7627-201ENSMUST00000183205 999 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Alpk3Q924C5 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Alpk3Q924C5 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Alpk3Q924C5 Tnfrsf18-201ENSMUST00000040274 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Alpk3Q924C5 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Alpk3Q924C5 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Alpk3Q924C5 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Alpk3Q924C5 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Alpk3Q924C5 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Alpk3Q924C5 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Alpk3Q924C5 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Alpk3Q924C5 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Alpk3Q924C5 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Alpk3Q924C5 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Alpk3Q924C5 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Alpk3Q924C5 AC107763.1-201ENSMUST00000226082 1365 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Alpk3Q924C5 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Alpk3Q924C5 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Alpk3Q924C5 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Alpk3Q924C5 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Alpk3Q924C5 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Alpk3Q924C5 Nnmt-202ENSMUST00000119426 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Alpk3Q924C5 Pfdn5-203ENSMUST00000165671 830 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Alpk3Q924C5 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Alpk3Q924C5 Gm7238-201ENSMUST00000206467 973 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Alpk3Q924C5 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Alpk3Q924C5 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Alpk3Q924C5 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Alpk3Q924C5 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Alpk3Q924C5 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Alpk3Q924C5 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Alpk3Q924C5 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Alpk3Q924C5 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Alpk3Q924C5 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Alpk3Q924C5 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Alpk3Q924C5 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Alpk3Q924C5 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Alpk3Q924C5 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Alpk3Q924C5 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Alpk3Q924C5 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Alpk3Q924C5 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Alpk3Q924C5 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Alpk3Q924C5 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Alpk3Q924C5 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Alpk3Q924C5 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Alpk3Q924C5 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Alpk3Q924C5 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Alpk3Q924C5 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Alpk3Q924C5 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Alpk3Q924C5 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Alpk3Q924C5 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Alpk3Q924C5 Gm14004-201ENSMUST00000138875 590 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Alpk3Q924C5 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Alpk3Q924C5 Gm38007-201ENSMUST00000192187 313 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Alpk3Q924C5 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms