Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim59Q922Y2 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim59Q922Y2 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim59Q922Y2 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim59Q922Y2 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim59Q922Y2 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim59Q922Y2 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim59Q922Y2 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim59Q922Y2 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim59Q922Y2 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim59Q922Y2 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim59Q922Y2 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim59Q922Y2 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim59Q922Y2 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim59Q922Y2 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim59Q922Y2 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
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Trim59Q922Y2 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim59Q922Y2 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim59Q922Y2 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Trim59Q922Y2 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim59Q922Y2 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim59Q922Y2 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim59Q922Y2 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim59Q922Y2 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim59Q922Y2 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim59Q922Y2 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim59Q922Y2 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim59Q922Y2 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim59Q922Y2 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim59Q922Y2 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim59Q922Y2 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim59Q922Y2 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim59Q922Y2 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim59Q922Y2 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim59Q922Y2 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Trim59Q922Y2 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Trim59Q922Y2 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Trim59Q922Y2 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Trim59Q922Y2 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim59Q922Y2 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms