Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atl3Q91YH5 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms