Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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