Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDF2

Uhrf1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1Q8VDF2 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
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Uhrf1Q8VDF2 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Uhrf1Q8VDF2 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Uhrf1Q8VDF2 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Uhrf1Q8VDF2 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Uhrf1Q8VDF2 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Uhrf1Q8VDF2 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Uhrf1Q8VDF2 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Uhrf1Q8VDF2 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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