Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCG9

Rfxap, Regulatory factor X-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfxapQ8VCG9 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RfxapQ8VCG9 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RfxapQ8VCG9 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RfxapQ8VCG9 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RfxapQ8VCG9 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RfxapQ8VCG9 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RfxapQ8VCG9 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RfxapQ8VCG9 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RfxapQ8VCG9 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RfxapQ8VCG9 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RfxapQ8VCG9 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RfxapQ8VCG9 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RfxapQ8VCG9 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
RfxapQ8VCG9 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RfxapQ8VCG9 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RfxapQ8VCG9 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RfxapQ8VCG9 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RfxapQ8VCG9 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RfxapQ8VCG9 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RfxapQ8VCG9 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
RfxapQ8VCG9 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
RfxapQ8VCG9 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
RfxapQ8VCG9 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
RfxapQ8VCG9 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RfxapQ8VCG9 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RfxapQ8VCG9 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RfxapQ8VCG9 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RfxapQ8VCG9 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RfxapQ8VCG9 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms