Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vmn1r200Q8R281 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vmn1r200Q8R281 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vmn1r200Q8R281 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Vmn1r200Q8R281 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Vmn1r200Q8R281 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Vmn1r200Q8R281 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r200Q8R281 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r200Q8R281 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r200Q8R281 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r200Q8R281 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r200Q8R281 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r200Q8R281 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r200Q8R281 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r200Q8R281 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r200Q8R281 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r200Q8R281 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r200Q8R281 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r200Q8R281 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r200Q8R281 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r200Q8R281 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r200Q8R281 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r200Q8R281 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r200Q8R281 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r200Q8R281 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Vmn1r200Q8R281 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r200Q8R281 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r200Q8R281 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r200Q8R281 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r200Q8R281 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r200Q8R281 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Vmn1r200Q8R281 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r200Q8R281 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r200Q8R281 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r200Q8R281 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Vmn1r200Q8R281 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r200Q8R281 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
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Vmn1r200Q8R281 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r200Q8R281 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r200Q8R281 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Vmn1r200Q8R281 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r200Q8R281 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r200Q8R281 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r200Q8R281 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vmn1r200Q8R281 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vmn1r200Q8R281 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vmn1r200Q8R281 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vmn1r200Q8R281 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vmn1r200Q8R281 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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Vmn1r200Q8R281 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
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Vmn1r200Q8R281 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vmn1r200Q8R281 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vmn1r200Q8R281 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vmn1r200Q8R281 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vmn1r200Q8R281 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vmn1r200Q8R281 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
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Vmn1r200Q8R281 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vmn1r200Q8R281 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vmn1r200Q8R281 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vmn1r200Q8R281 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vmn1r200Q8R281 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vmn1r200Q8R281 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Vmn1r200Q8R281 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vmn1r200Q8R281 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vmn1r200Q8R281 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vmn1r200Q8R281 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vmn1r200Q8R281 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vmn1r200Q8R281 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vmn1r200Q8R281 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vmn1r200Q8R281 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vmn1r200Q8R281 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vmn1r200Q8R281 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vmn1r200Q8R281 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Vmn1r200Q8R281 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vmn1r200Q8R281 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vmn1r200Q8R281 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vmn1r200Q8R281 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vmn1r200Q8R281 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vmn1r200Q8R281 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
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