Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

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Length 190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Rnf183Q8QZS5 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Rnf183Q8QZS5 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Rnf183Q8QZS5 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Rnf183Q8QZS5 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Rnf183Q8QZS5 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Rnf183Q8QZS5 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms