Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms