Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms