Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2X3

Stn1, CST complex subunit STN1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stn1Q8K2X3 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Stn1Q8K2X3 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms