Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2I2

Cchcr1, Coiled-coil alpha-helical rod protein 1, mousemouse

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Length 770 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cchcr1Q8K2I2 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cchcr1Q8K2I2 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cchcr1Q8K2I2 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cchcr1Q8K2I2 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cchcr1Q8K2I2 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cchcr1Q8K2I2 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cchcr1Q8K2I2 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cchcr1Q8K2I2 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cchcr1Q8K2I2 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cchcr1Q8K2I2 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cchcr1Q8K2I2 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cchcr1Q8K2I2 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cchcr1Q8K2I2 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cchcr1Q8K2I2 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cchcr1Q8K2I2 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cchcr1Q8K2I2 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cchcr1Q8K2I2 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cchcr1Q8K2I2 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cchcr1Q8K2I2 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cchcr1Q8K2I2 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cchcr1Q8K2I2 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cchcr1Q8K2I2 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cchcr1Q8K2I2 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cchcr1Q8K2I2 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cchcr1Q8K2I2 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cchcr1Q8K2I2 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cchcr1Q8K2I2 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cchcr1Q8K2I2 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cchcr1Q8K2I2 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cchcr1Q8K2I2 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cchcr1Q8K2I2 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cchcr1Q8K2I2 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cchcr1Q8K2I2 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cchcr1Q8K2I2 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cchcr1Q8K2I2 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cchcr1Q8K2I2 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cchcr1Q8K2I2 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cchcr1Q8K2I2 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cchcr1Q8K2I2 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cchcr1Q8K2I2 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cchcr1Q8K2I2 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cchcr1Q8K2I2 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cchcr1Q8K2I2 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cchcr1Q8K2I2 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cchcr1Q8K2I2 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cchcr1Q8K2I2 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cchcr1Q8K2I2 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cchcr1Q8K2I2 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cchcr1Q8K2I2 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cchcr1Q8K2I2 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cchcr1Q8K2I2 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cchcr1Q8K2I2 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cchcr1Q8K2I2 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cchcr1Q8K2I2 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cchcr1Q8K2I2 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cchcr1Q8K2I2 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cchcr1Q8K2I2 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cchcr1Q8K2I2 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cchcr1Q8K2I2 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cchcr1Q8K2I2 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cchcr1Q8K2I2 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cchcr1Q8K2I2 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cchcr1Q8K2I2 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cchcr1Q8K2I2 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cchcr1Q8K2I2 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cchcr1Q8K2I2 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cchcr1Q8K2I2 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cchcr1Q8K2I2 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cchcr1Q8K2I2 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cchcr1Q8K2I2 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cchcr1Q8K2I2 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cchcr1Q8K2I2 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cchcr1Q8K2I2 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cchcr1Q8K2I2 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cchcr1Q8K2I2 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cchcr1Q8K2I2 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cchcr1Q8K2I2 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cchcr1Q8K2I2 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cchcr1Q8K2I2 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cchcr1Q8K2I2 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cchcr1Q8K2I2 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cchcr1Q8K2I2 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cchcr1Q8K2I2 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cchcr1Q8K2I2 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cchcr1Q8K2I2 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cchcr1Q8K2I2 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cchcr1Q8K2I2 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cchcr1Q8K2I2 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cchcr1Q8K2I2 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cchcr1Q8K2I2 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cchcr1Q8K2I2 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cchcr1Q8K2I2 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cchcr1Q8K2I2 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cchcr1Q8K2I2 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cchcr1Q8K2I2 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cchcr1Q8K2I2 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cchcr1Q8K2I2 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cchcr1Q8K2I2 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cchcr1Q8K2I2 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cchcr1Q8K2I2 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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