Protein–RNA interactions for Protein: Q8K194

Snrnp27, U4/U6.U5 small nuclear ribonucleoprotein 27 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp27Q8K194 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snrnp27Q8K194 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snrnp27Q8K194 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snrnp27Q8K194 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snrnp27Q8K194 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snrnp27Q8K194 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snrnp27Q8K194 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snrnp27Q8K194 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snrnp27Q8K194 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snrnp27Q8K194 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snrnp27Q8K194 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Snrnp27Q8K194 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Snrnp27Q8K194 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snrnp27Q8K194 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snrnp27Q8K194 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Snrnp27Q8K194 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snrnp27Q8K194 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snrnp27Q8K194 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snrnp27Q8K194 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snrnp27Q8K194 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Snrnp27Q8K194 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Snrnp27Q8K194 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snrnp27Q8K194 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snrnp27Q8K194 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snrnp27Q8K194 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snrnp27Q8K194 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snrnp27Q8K194 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snrnp27Q8K194 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snrnp27Q8K194 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Snrnp27Q8K194 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snrnp27Q8K194 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snrnp27Q8K194 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snrnp27Q8K194 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snrnp27Q8K194 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snrnp27Q8K194 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snrnp27Q8K194 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snrnp27Q8K194 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snrnp27Q8K194 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snrnp27Q8K194 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snrnp27Q8K194 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Snrnp27Q8K194 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snrnp27Q8K194 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snrnp27Q8K194 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snrnp27Q8K194 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snrnp27Q8K194 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snrnp27Q8K194 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snrnp27Q8K194 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snrnp27Q8K194 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snrnp27Q8K194 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snrnp27Q8K194 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snrnp27Q8K194 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snrnp27Q8K194 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snrnp27Q8K194 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snrnp27Q8K194 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snrnp27Q8K194 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snrnp27Q8K194 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snrnp27Q8K194 Gm20089-201ENSMUST00000192391 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snrnp27Q8K194 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snrnp27Q8K194 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snrnp27Q8K194 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snrnp27Q8K194 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snrnp27Q8K194 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Snrnp27Q8K194 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snrnp27Q8K194 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snrnp27Q8K194 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snrnp27Q8K194 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snrnp27Q8K194 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Snrnp27Q8K194 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snrnp27Q8K194 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Snrnp27Q8K194 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snrnp27Q8K194 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snrnp27Q8K194 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snrnp27Q8K194 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snrnp27Q8K194 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snrnp27Q8K194 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snrnp27Q8K194 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snrnp27Q8K194 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snrnp27Q8K194 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snrnp27Q8K194 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snrnp27Q8K194 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snrnp27Q8K194 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snrnp27Q8K194 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snrnp27Q8K194 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snrnp27Q8K194 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snrnp27Q8K194 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snrnp27Q8K194 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Snrnp27Q8K194 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snrnp27Q8K194 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snrnp27Q8K194 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snrnp27Q8K194 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snrnp27Q8K194 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Snrnp27Q8K194 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snrnp27Q8K194 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Snrnp27Q8K194 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Snrnp27Q8K194 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Snrnp27Q8K194 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Snrnp27Q8K194 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Snrnp27Q8K194 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Snrnp27Q8K194 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Snrnp27Q8K194 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms