Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
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