Protein–RNA interactions for Protein: Q8K099

Lrit1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit1Q8K099 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrit1Q8K099 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrit1Q8K099 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrit1Q8K099 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrit1Q8K099 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrit1Q8K099 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrit1Q8K099 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrit1Q8K099 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrit1Q8K099 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrit1Q8K099 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrit1Q8K099 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrit1Q8K099 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrit1Q8K099 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrit1Q8K099 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrit1Q8K099 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrit1Q8K099 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrit1Q8K099 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrit1Q8K099 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrit1Q8K099 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrit1Q8K099 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrit1Q8K099 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrit1Q8K099 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrit1Q8K099 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrit1Q8K099 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrit1Q8K099 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrit1Q8K099 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrit1Q8K099 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrit1Q8K099 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrit1Q8K099 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrit1Q8K099 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrit1Q8K099 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrit1Q8K099 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrit1Q8K099 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrit1Q8K099 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrit1Q8K099 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrit1Q8K099 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrit1Q8K099 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrit1Q8K099 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrit1Q8K099 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrit1Q8K099 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrit1Q8K099 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrit1Q8K099 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrit1Q8K099 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrit1Q8K099 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrit1Q8K099 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrit1Q8K099 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrit1Q8K099 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrit1Q8K099 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrit1Q8K099 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrit1Q8K099 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrit1Q8K099 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrit1Q8K099 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrit1Q8K099 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrit1Q8K099 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrit1Q8K099 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrit1Q8K099 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrit1Q8K099 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrit1Q8K099 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrit1Q8K099 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrit1Q8K099 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrit1Q8K099 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrit1Q8K099 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrit1Q8K099 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrit1Q8K099 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrit1Q8K099 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrit1Q8K099 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrit1Q8K099 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrit1Q8K099 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrit1Q8K099 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrit1Q8K099 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrit1Q8K099 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrit1Q8K099 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrit1Q8K099 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrit1Q8K099 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrit1Q8K099 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrit1Q8K099 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrit1Q8K099 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrit1Q8K099 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrit1Q8K099 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrit1Q8K099 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrit1Q8K099 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrit1Q8K099 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrit1Q8K099 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrit1Q8K099 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrit1Q8K099 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrit1Q8K099 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrit1Q8K099 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrit1Q8K099 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrit1Q8K099 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrit1Q8K099 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrit1Q8K099 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrit1Q8K099 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrit1Q8K099 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrit1Q8K099 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrit1Q8K099 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrit1Q8K099 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrit1Q8K099 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrit1Q8K099 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrit1Q8K099 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrit1Q8K099 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms