Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Upp2Q8CGR7 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Upp2Q8CGR7 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Upp2Q8CGR7 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Upp2Q8CGR7 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Upp2Q8CGR7 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Upp2Q8CGR7 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Upp2Q8CGR7 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Upp2Q8CGR7 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Upp2Q8CGR7 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Upp2Q8CGR7 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Upp2Q8CGR7 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Upp2Q8CGR7 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Upp2Q8CGR7 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Upp2Q8CGR7 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Upp2Q8CGR7 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Upp2Q8CGR7 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Upp2Q8CGR7 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Upp2Q8CGR7 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Upp2Q8CGR7 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Upp2Q8CGR7 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Upp2Q8CGR7 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Upp2Q8CGR7 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Upp2Q8CGR7 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Upp2Q8CGR7 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Upp2Q8CGR7 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Upp2Q8CGR7 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Upp2Q8CGR7 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Upp2Q8CGR7 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Upp2Q8CGR7 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Upp2Q8CGR7 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Upp2Q8CGR7 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Upp2Q8CGR7 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Upp2Q8CGR7 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Upp2Q8CGR7 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Upp2Q8CGR7 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Upp2Q8CGR7 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Upp2Q8CGR7 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Upp2Q8CGR7 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Upp2Q8CGR7 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Upp2Q8CGR7 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Upp2Q8CGR7 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Upp2Q8CGR7 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Upp2Q8CGR7 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Upp2Q8CGR7 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Upp2Q8CGR7 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Upp2Q8CGR7 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Upp2Q8CGR7 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Upp2Q8CGR7 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Upp2Q8CGR7 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Upp2Q8CGR7 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Upp2Q8CGR7 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Upp2Q8CGR7 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Upp2Q8CGR7 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Upp2Q8CGR7 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Upp2Q8CGR7 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Upp2Q8CGR7 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Upp2Q8CGR7 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Upp2Q8CGR7 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Upp2Q8CGR7 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Upp2Q8CGR7 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Upp2Q8CGR7 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Upp2Q8CGR7 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Upp2Q8CGR7 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Upp2Q8CGR7 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Upp2Q8CGR7 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Upp2Q8CGR7 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Upp2Q8CGR7 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Upp2Q8CGR7 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Upp2Q8CGR7 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Upp2Q8CGR7 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Upp2Q8CGR7 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Upp2Q8CGR7 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Upp2Q8CGR7 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Upp2Q8CGR7 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Upp2Q8CGR7 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Upp2Q8CGR7 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Upp2Q8CGR7 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Upp2Q8CGR7 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Upp2Q8CGR7 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Upp2Q8CGR7 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Upp2Q8CGR7 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Upp2Q8CGR7 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Upp2Q8CGR7 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Upp2Q8CGR7 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Upp2Q8CGR7 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Upp2Q8CGR7 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Upp2Q8CGR7 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Upp2Q8CGR7 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Upp2Q8CGR7 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Upp2Q8CGR7 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Upp2Q8CGR7 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Upp2Q8CGR7 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Upp2Q8CGR7 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Upp2Q8CGR7 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Upp2Q8CGR7 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Upp2Q8CGR7 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Upp2Q8CGR7 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Upp2Q8CGR7 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Upp2Q8CGR7 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.3 ms