Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGC6

Rbm28, RNA-binding protein 28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 750 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm28Q8CGC6 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbm28Q8CGC6 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rbm28Q8CGC6 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rbm28Q8CGC6 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rbm28Q8CGC6 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rbm28Q8CGC6 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbm28Q8CGC6 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbm28Q8CGC6 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbm28Q8CGC6 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbm28Q8CGC6 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbm28Q8CGC6 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbm28Q8CGC6 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbm28Q8CGC6 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbm28Q8CGC6 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbm28Q8CGC6 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbm28Q8CGC6 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbm28Q8CGC6 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbm28Q8CGC6 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbm28Q8CGC6 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbm28Q8CGC6 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbm28Q8CGC6 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbm28Q8CGC6 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbm28Q8CGC6 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbm28Q8CGC6 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbm28Q8CGC6 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbm28Q8CGC6 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbm28Q8CGC6 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbm28Q8CGC6 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms