Protein–RNA interactions for Protein: Q8C708

Transmembrane protein C16orf54 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C708 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q8C708 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q8C708 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q8C708 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Q8C708 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q8C708 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Q8C708 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q8C708 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q8C708 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q8C708 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Q8C708 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Q8C708 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Q8C708 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Q8C708 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q8C708 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Q8C708 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q8C708 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q8C708 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q8C708 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q8C708 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q8C708 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q8C708 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q8C708 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q8C708 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q8C708 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q8C708 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q8C708 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q8C708 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q8C708 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q8C708 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q8C708 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q8C708 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q8C708 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q8C708 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q8C708 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q8C708 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q8C708 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q8C708 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q8C708 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q8C708 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q8C708 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q8C708 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q8C708 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q8C708 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q8C708 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q8C708 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q8C708 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q8C708 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q8C708 Gm15271-201ENSMUST00000134627 2110 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q8C708 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q8C708 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q8C708 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Q8C708 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q8C708 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q8C708 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Q8C708 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q8C708 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q8C708 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q8C708 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q8C708 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q8C708 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q8C708 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q8C708 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q8C708 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q8C708 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q8C708 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Q8C708 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Q8C708 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Q8C708 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q8C708 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q8C708 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q8C708 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q8C708 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q8C708 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q8C708 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Q8C708 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q8C708 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q8C708 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q8C708 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q8C708 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q8C708 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q8C708 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q8C708 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q8C708 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q8C708 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q8C708 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q8C708 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q8C708 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q8C708 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q8C708 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q8C708 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q8C708 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q8C708 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q8C708 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q8C708 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q8C708 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q8C708 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q8C708 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q8C708 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q8C708 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms