Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U9

Ubqln3, Ubiquilin-3, mousemouse

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Length 658 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln3Q8C5U9 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
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Ubqln3Q8C5U9 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
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Ubqln3Q8C5U9 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
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Ubqln3Q8C5U9 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
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Ubqln3Q8C5U9 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
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Ubqln3Q8C5U9 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
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Ubqln3Q8C5U9 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ubqln3Q8C5U9 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ubqln3Q8C5U9 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ubqln3Q8C5U9 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ubqln3Q8C5U9 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ubqln3Q8C5U9 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ubqln3Q8C5U9 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ubqln3Q8C5U9 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ubqln3Q8C5U9 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms