Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Ccdc113Q8C5T8 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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