Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q4

Nek11, Serine/threonine-protein kinase Nek11, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek11Q8C0Q4 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.9 ms