Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
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Ube3dQ8BX13 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Ube3dQ8BX13 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Ube3dQ8BX13 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Ube3dQ8BX13 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Ube3dQ8BX13 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Ube3dQ8BX13 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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