Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWP5

Ttpa, Alpha-tocopherol transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtpaQ8BWP5 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms