Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp38Q8BW70 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp38Q8BW70 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp38Q8BW70 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp38Q8BW70 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp38Q8BW70 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp38Q8BW70 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp38Q8BW70 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp38Q8BW70 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp38Q8BW70 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp38Q8BW70 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp38Q8BW70 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp38Q8BW70 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp38Q8BW70 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp38Q8BW70 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp38Q8BW70 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp38Q8BW70 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp38Q8BW70 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp38Q8BW70 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp38Q8BW70 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp38Q8BW70 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp38Q8BW70 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp38Q8BW70 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp38Q8BW70 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp38Q8BW70 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp38Q8BW70 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp38Q8BW70 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp38Q8BW70 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp38Q8BW70 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp38Q8BW70 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp38Q8BW70 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp38Q8BW70 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp38Q8BW70 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp38Q8BW70 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp38Q8BW70 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp38Q8BW70 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp38Q8BW70 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp38Q8BW70 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp38Q8BW70 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp38Q8BW70 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp38Q8BW70 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp38Q8BW70 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp38Q8BW70 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp38Q8BW70 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp38Q8BW70 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp38Q8BW70 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp38Q8BW70 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp38Q8BW70 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp38Q8BW70 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp38Q8BW70 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp38Q8BW70 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp38Q8BW70 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp38Q8BW70 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp38Q8BW70 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp38Q8BW70 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp38Q8BW70 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp38Q8BW70 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp38Q8BW70 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp38Q8BW70 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp38Q8BW70 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp38Q8BW70 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp38Q8BW70 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp38Q8BW70 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Usp38Q8BW70 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Usp38Q8BW70 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp38Q8BW70 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp38Q8BW70 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp38Q8BW70 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp38Q8BW70 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp38Q8BW70 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp38Q8BW70 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp38Q8BW70 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Usp38Q8BW70 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp38Q8BW70 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp38Q8BW70 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Usp38Q8BW70 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp38Q8BW70 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp38Q8BW70 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp38Q8BW70 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp38Q8BW70 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp38Q8BW70 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp38Q8BW70 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp38Q8BW70 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp38Q8BW70 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp38Q8BW70 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp38Q8BW70 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp38Q8BW70 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp38Q8BW70 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp38Q8BW70 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp38Q8BW70 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp38Q8BW70 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp38Q8BW70 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp38Q8BW70 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp38Q8BW70 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp38Q8BW70 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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