Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Pggt1bQ8BUY9 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Pggt1bQ8BUY9 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Pggt1bQ8BUY9 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Pggt1bQ8BUY9 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Pggt1bQ8BUY9 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Pggt1bQ8BUY9 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Pggt1bQ8BUY9 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Pggt1bQ8BUY9 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Pggt1bQ8BUY9 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Pggt1bQ8BUY9 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Pggt1bQ8BUY9 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
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Pggt1bQ8BUY9 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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