Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp54Q8BL06 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp54Q8BL06 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp54Q8BL06 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp54Q8BL06 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp54Q8BL06 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp54Q8BL06 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp54Q8BL06 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp54Q8BL06 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 150.2 ms