Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms