Protein–RNA interactions for Protein: Q80VR2

Ell3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell3Q80VR2 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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