Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSY8

Sgo2, Shugoshin 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo2Q7TSY8 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sgo2Q7TSY8 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sgo2Q7TSY8 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sgo2Q7TSY8 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sgo2Q7TSY8 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sgo2Q7TSY8 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sgo2Q7TSY8 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sgo2Q7TSY8 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sgo2Q7TSY8 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sgo2Q7TSY8 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sgo2Q7TSY8 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms