Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Gm10488-201ENSMUST00000101657 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Cep97-204ENSMUST00000121129 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Gm13792-201ENSMUST00000121350 423 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Gm6121-202ENSMUST00000167438 893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Gm17711-201ENSMUST00000172028 237 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Gm22906-201ENSMUST00000175191 250 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Gm4836-201ENSMUST00000179874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Gm10096-202ENSMUST00000180207 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Tceanc-203ENSMUST00000180322 1080 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Gm10487-202ENSMUST00000180344 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Gm45488-201ENSMUST00000210747 371 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Olfr1077-ps1-201ENSMUST00000213225 1212 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Gm10058-201ENSMUST00000079797 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Olfr1098-201ENSMUST00000099872 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Ctdspl2-203ENSMUST00000110574 1616 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Gm11342-203ENSMUST00000224879 1324 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Mrps14-203ENSMUST00000135680 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Gm35202-201ENSMUST00000130083 712 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 B230112G18Rik-201ENSMUST00000192979 851 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Gm45258-201ENSMUST00000210042 853 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 AC161250.1-201ENSMUST00000213426 1111 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 AC153816.1-201ENSMUST00000217870 764 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 AC153532.1-201ENSMUST00000218126 1111 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Nsmce2-201ENSMUST00000079703 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms