Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms