Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS3

Ssx9, MCG116991, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssx9Q6XAS3 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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