Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Ccdc88cQ6VGS5 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Ccdc88cQ6VGS5 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Ccdc88cQ6VGS5 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Ccdc88cQ6VGS5 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ccdc88cQ6VGS5 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ccdc88cQ6VGS5 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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Ccdc88cQ6VGS5 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ccdc88cQ6VGS5 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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Ccdc88cQ6VGS5 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc88cQ6VGS5 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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Ccdc88cQ6VGS5 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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Ccdc88cQ6VGS5 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc88cQ6VGS5 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc88cQ6VGS5 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc88cQ6VGS5 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc88cQ6VGS5 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc88cQ6VGS5 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccdc88cQ6VGS5 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccdc88cQ6VGS5 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccdc88cQ6VGS5 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccdc88cQ6VGS5 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccdc88cQ6VGS5 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccdc88cQ6VGS5 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccdc88cQ6VGS5 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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