Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
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Atp8b3Q6UQ17 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
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Atp8b3Q6UQ17 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Atp8b3Q6UQ17 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp8b3Q6UQ17 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Atp8b3Q6UQ17 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp8b3Q6UQ17 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp8b3Q6UQ17 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Atp8b3Q6UQ17 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Atp8b3Q6UQ17 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Atp8b3Q6UQ17 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Atp8b3Q6UQ17 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Atp8b3Q6UQ17 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp8b3Q6UQ17 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp8b3Q6UQ17 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp8b3Q6UQ17 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp8b3Q6UQ17 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp8b3Q6UQ17 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp8b3Q6UQ17 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp8b3Q6UQ17 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp8b3Q6UQ17 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp8b3Q6UQ17 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp8b3Q6UQ17 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp8b3Q6UQ17 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp8b3Q6UQ17 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp8b3Q6UQ17 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp8b3Q6UQ17 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp8b3Q6UQ17 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp8b3Q6UQ17 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
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