Protein–RNA interactions for Protein: Q6RHW0

Krt9, Keratin, type I cytoskeletal 9, mousemouse

Predictions only

Length 743 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt9Q6RHW0 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt9Q6RHW0 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt9Q6RHW0 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt9Q6RHW0 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt9Q6RHW0 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt9Q6RHW0 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt9Q6RHW0 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt9Q6RHW0 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt9Q6RHW0 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt9Q6RHW0 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt9Q6RHW0 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt9Q6RHW0 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt9Q6RHW0 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt9Q6RHW0 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt9Q6RHW0 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt9Q6RHW0 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt9Q6RHW0 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt9Q6RHW0 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt9Q6RHW0 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt9Q6RHW0 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt9Q6RHW0 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt9Q6RHW0 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt9Q6RHW0 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt9Q6RHW0 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt9Q6RHW0 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt9Q6RHW0 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt9Q6RHW0 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt9Q6RHW0 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt9Q6RHW0 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt9Q6RHW0 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt9Q6RHW0 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt9Q6RHW0 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt9Q6RHW0 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt9Q6RHW0 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt9Q6RHW0 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt9Q6RHW0 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt9Q6RHW0 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt9Q6RHW0 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt9Q6RHW0 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt9Q6RHW0 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt9Q6RHW0 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt9Q6RHW0 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt9Q6RHW0 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt9Q6RHW0 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt9Q6RHW0 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt9Q6RHW0 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt9Q6RHW0 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt9Q6RHW0 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt9Q6RHW0 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt9Q6RHW0 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt9Q6RHW0 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt9Q6RHW0 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt9Q6RHW0 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt9Q6RHW0 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt9Q6RHW0 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt9Q6RHW0 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt9Q6RHW0 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt9Q6RHW0 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt9Q6RHW0 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt9Q6RHW0 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt9Q6RHW0 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt9Q6RHW0 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt9Q6RHW0 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt9Q6RHW0 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt9Q6RHW0 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt9Q6RHW0 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt9Q6RHW0 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt9Q6RHW0 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt9Q6RHW0 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt9Q6RHW0 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt9Q6RHW0 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt9Q6RHW0 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt9Q6RHW0 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt9Q6RHW0 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt9Q6RHW0 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt9Q6RHW0 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt9Q6RHW0 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms