Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SvoplQ6PDF3 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SvoplQ6PDF3 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
SvoplQ6PDF3 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
SvoplQ6PDF3 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
SvoplQ6PDF3 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
SvoplQ6PDF3 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms