Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCN3

Ttbk1, Tau-tubulin kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttbk1Q6PCN3 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttbk1Q6PCN3 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttbk1Q6PCN3 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttbk1Q6PCN3 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttbk1Q6PCN3 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttbk1Q6PCN3 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttbk1Q6PCN3 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttbk1Q6PCN3 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttbk1Q6PCN3 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttbk1Q6PCN3 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttbk1Q6PCN3 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttbk1Q6PCN3 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttbk1Q6PCN3 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttbk1Q6PCN3 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttbk1Q6PCN3 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttbk1Q6PCN3 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttbk1Q6PCN3 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttbk1Q6PCN3 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttbk1Q6PCN3 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttbk1Q6PCN3 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttbk1Q6PCN3 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttbk1Q6PCN3 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttbk1Q6PCN3 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttbk1Q6PCN3 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttbk1Q6PCN3 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttbk1Q6PCN3 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttbk1Q6PCN3 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttbk1Q6PCN3 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttbk1Q6PCN3 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttbk1Q6PCN3 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttbk1Q6PCN3 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttbk1Q6PCN3 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttbk1Q6PCN3 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttbk1Q6PCN3 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttbk1Q6PCN3 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttbk1Q6PCN3 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttbk1Q6PCN3 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttbk1Q6PCN3 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttbk1Q6PCN3 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttbk1Q6PCN3 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttbk1Q6PCN3 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttbk1Q6PCN3 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttbk1Q6PCN3 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttbk1Q6PCN3 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttbk1Q6PCN3 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttbk1Q6PCN3 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttbk1Q6PCN3 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttbk1Q6PCN3 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttbk1Q6PCN3 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttbk1Q6PCN3 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttbk1Q6PCN3 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttbk1Q6PCN3 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttbk1Q6PCN3 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttbk1Q6PCN3 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttbk1Q6PCN3 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttbk1Q6PCN3 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttbk1Q6PCN3 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttbk1Q6PCN3 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttbk1Q6PCN3 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttbk1Q6PCN3 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttbk1Q6PCN3 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttbk1Q6PCN3 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttbk1Q6PCN3 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttbk1Q6PCN3 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttbk1Q6PCN3 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttbk1Q6PCN3 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttbk1Q6PCN3 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttbk1Q6PCN3 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttbk1Q6PCN3 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttbk1Q6PCN3 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttbk1Q6PCN3 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttbk1Q6PCN3 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttbk1Q6PCN3 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttbk1Q6PCN3 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttbk1Q6PCN3 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttbk1Q6PCN3 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttbk1Q6PCN3 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttbk1Q6PCN3 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttbk1Q6PCN3 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttbk1Q6PCN3 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttbk1Q6PCN3 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttbk1Q6PCN3 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttbk1Q6PCN3 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttbk1Q6PCN3 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttbk1Q6PCN3 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttbk1Q6PCN3 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttbk1Q6PCN3 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttbk1Q6PCN3 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttbk1Q6PCN3 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttbk1Q6PCN3 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttbk1Q6PCN3 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttbk1Q6PCN3 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttbk1Q6PCN3 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttbk1Q6PCN3 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttbk1Q6PCN3 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttbk1Q6PCN3 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttbk1Q6PCN3 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttbk1Q6PCN3 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttbk1Q6PCN3 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttbk1Q6PCN3 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms