Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CltbQ6IRU5 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms