Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Krt39Q6IFX4 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Krt39Q6IFX4 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Krt39Q6IFX4 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Krt39Q6IFX4 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Krt39Q6IFX4 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Krt39Q6IFX4 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Krt39Q6IFX4 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Krt39Q6IFX4 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Krt39Q6IFX4 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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