Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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PtprdQ64487 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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PtprdQ64487 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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PtprdQ64487 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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PtprdQ64487 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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PtprdQ64487 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
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PtprdQ64487 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
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PtprdQ64487 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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PtprdQ64487 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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PtprdQ64487 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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PtprdQ64487 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
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PtprdQ64487 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms