Protein–RNA interactions for Protein: Q64287

Irf4, Interferon regulatory factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf4Q64287 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.3 ms