Protein–RNA interactions for Protein: Q64016

Defa17, Alpha-defensin 17 (Fragment), mousemouse

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Length 82 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa17Q64016 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa17Q64016 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa17Q64016 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa17Q64016 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa17Q64016 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa17Q64016 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa17Q64016 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa17Q64016 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa17Q64016 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa17Q64016 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa17Q64016 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa17Q64016 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa17Q64016 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa17Q64016 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa17Q64016 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa17Q64016 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Defa17Q64016 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Defa17Q64016 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa17Q64016 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Defa17Q64016 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa17Q64016 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa17Q64016 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Defa17Q64016 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa17Q64016 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa17Q64016 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa17Q64016 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa17Q64016 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa17Q64016 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa17Q64016 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa17Q64016 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa17Q64016 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa17Q64016 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa17Q64016 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Defa17Q64016 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa17Q64016 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa17Q64016 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa17Q64016 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa17Q64016 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa17Q64016 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
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Defa17Q64016 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Defa17Q64016 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa17Q64016 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa17Q64016 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa17Q64016 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa17Q64016 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa17Q64016 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa17Q64016 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa17Q64016 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa17Q64016 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa17Q64016 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa17Q64016 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa17Q64016 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa17Q64016 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa17Q64016 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa17Q64016 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa17Q64016 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Defa17Q64016 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms